По договору коммерческой концессии одна сторона (правообладатель) обязуется предоставить другой стороне (пользователю) за вознаграждение на срок или без указания срока право использовать в предпринимательской деятельности пользователя комплекс принадлежащих правообладателю исключительных прав, включающий право на товарный знак, знак обслуживания, а также права на другие предусмотренные договором объекты исключительных прав, в частности на коммерческое обозначение, секрет производства (п. 1 ст. 1027 ГК РФ). 

В силу п. 3 указанной статьи сторонами по договору коммерческой концессии могут быть коммерческие организации и граждане, зарегистрированные в качестве индивидуальных предпринимателей. Частные учреждения являются некоммерческими организациями (подп. 8 п. 3 ст. 50, ст. 123.21 ГК РФ), поэтому в силу п. 3 ст. 1027 ГК РФ стороной договора коммерческой концессии быть не могут. В силу положений ст. 168 ГК РФ сделка, не соответствующая требованиям закона, по общему правилу является оспоримой. Требование о признании оспоримой сделки недействительной может быть предъявлено только стороной сделки или иным лицом, права которого нарушаются (п. 2 ст. 166 ГК РФ). Несоответствие сделки требованиям закона влечет ее ничтожность лишь в случаях, если это прямо предусмотрено законом или если сделка при этом посягает на публичные интересы либо права и охраняемые законом интересы третьих лиц, если из закона не следует, что такая сделка оспорима или должны применяться другие последствия нарушения, не связанные с недействительностью сделки. Мы не обнаружили материалов, где бы рассматривался вопрос о признании недействительным договора коммерческой концессии, стороной которого является некоммерческая организация. В судебной практике можно встретить примеры споров по заключенным с участием некоммерческих организаций договорам, поименованным как договоры коммерческой концессии (постановление Суда по интеллектуальным правам от 21 марта 2017 г. N С01-148/2017 по делу N А63-2528/2016, постановление Девятого арбитражного апелляционного суда от 9 апреля 2008 г. N 09АП-3290/2008). Однако в указанных делах вопрос о недействительности договора не затрагивался. 

На наш взгляд, в отсутствие явных оснований для оспаривания договора коммерческой концессии, заключенного учреждением, поименованный таким образом договор может в зависимости от обстоятельств квалифицироваться как лицензионный договор или как договор, не предусмотренный законом или иными правовыми актами договор (п. 2 ст. 421 ГК РФ). Последняя возможность косвенно подтверждается правоприменительной практикой, где рассматривались договоры простого товарищества, заключенные в целях осуществления предпринимательской деятельности, сторонами которых являлись лица, не указанные в п. 2 ст. 1041 ГК РФ (постановление Арбитражного суда Уральского округа от 20 октября 2014 г. N Ф09-5503/14 по делу N А76-6636/2013, кассационное определение СК по гражданским делам Астраханского областного суда от 9 ноября 2011 г. по делу N 33-3286/2011). В любом случае, на наш взгляд, к такому договору не должны применяться правила главы 54 ГК РФ. Однако однозначно оценить перспективу квалификации такого договора в случае возникновения спора между его сторонами в рамках этой консультации не представляется возможным.